Arkitekturen i Swarovski Crystal Worlds er en unik og fængslende blanding af kunst, kreativitet og moderne design, skabt af multimediekunstneren André Heller. Museets indre består af flere temakamre, der hver især er designet af forskellige kunstnere, designere og arkitekter. Der er brugt en kombination af materialer, herunder glas, stål, beton og natursten. Crystal Worlds' hovedbygning er delvist gravet ned i bjergskråningen og smelter harmonisk sammen med omgivelserne i et miljøvenligt design. Indgangen til museet er markeret af et gigantisk hoved, lavet af over 0,8 mio. håndmonterede krystaller, som er blevet et ikonisk symbol på Crystal Worlds internationalt. Det børnevenlige legetårn er designet af kunstneren Friedensreich Hundertwasser, og det står som et farverigt legeområde i kontrast til museets elegante krystaludstillinger.